全文编译！与中国无关！新研究表明SARS-CoV-2早在2019年12月下旬就已在法国传播

2020-05-11 01:30:09

[原文来自：www.ii77.com]

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论文题目

SARS-COV-2于2019年12月下旬就已在法国流传（SARS-COV-2 was already spreading in France in late December 2019）

论文作者来自法国塞纳-圣但尼病院集体、法国国度健康与医学研究院和巴黎大学

发文时间：2020年5月3日在线揭橥在国际期刊International Journal of Antimicrobial Agents上。

引言

法国于2020年1月24日申报了首批SARS-COV-2相关传染病例，2例病例均有前去中国武汉市的观光史。据我们所知，这2例病例被认为是法国的首批确诊病例。COVID-19最常伴有流感样疾病（influenza-like illness, ILI）。傍边国面临COVID-19爆发时，欧洲国度正与季候性流感作斗争。

鉴于COVID-19和流感样疾病之间的临床症状相似，是以我们决意回首性地在巴黎四周的我院（指的是塞纳-圣但尼病院，下同）重症监护室（ICU）收集的呼吸道样本中寻找SARS-COV-2。

方式-回首性剖析

选定的记录

我们回首性剖析2019年12月2日~2020年1月16日时代因ILI而住院的ICU患者的病历，入院时多重FilmArray PCR（可检测20种导致上呼吸道传染的常见病毒和细菌，包罗流感病毒、常见冠状病毒，但不包罗SARS-COV-2）测试究竟为阴性。

我院采集的每份呼吸道样本均在ThermoScientific公司的-86°C冷冻室中冷冻，留存4年，以备进一步剖析。凭据病历，对同时有ILI症状（发烧高于38.5°C、咳嗽、鼻炎、咽喉痛或肌痛）和磨玻璃样暗影（ground glass opacity）的患者采集的样本进行SARS-COV-2 RT-PCR。样本选择解说见图1。

图1.用于测试的样本选择过程。

COVID-19测试

在2020年4月6日~9日时代对14个选定的生物库进行了SARS-COV-2 RT-PCR测试。严厉按照Charité方案在QuantStudio7（Thermofisher）设备长进行针对SARS-COV和 SARS-COV-2泛基因组中编码包膜卵白的E基因的RT-PCR测试。凭据制造商的建议，用Gene finder COVID19 Plus RealAmp试剂盒（IFMR-45）对阳性究竟进行验证（图2）。

这种试剂盒针对3个病毒基因（RdRp、E和N基因，离别编码病毒RNA依靠性RNA聚合酶、包膜卵白和核衣壳卵白）和细胞RNAse P基因进行检测，以确认呼吸道样品的质量。

图2.遵照Charité方案的RT-PCR测试究竟。

研究究竟

在研究时代，我们的剖析中纳入了58例因ILI而住院的患者中的14例（24%）。个中1例样本为阳性，获取自一名42岁的在阿尔及利亚出生的男性，他在法国生活多年，是一名鱼商人。

他的最后一次观光是在2019年8月时代前去阿尔及利亚。在他的症状显现之前，他的一个孩子已显现了ILI。他的病史包罗哮喘和II型糖尿病。他显现咯血、咳嗽、头痛、发烧等症状，持续4天，并于2019年12月27日前去急诊病房。

初步搜检无非常，所做CT扫描显露双侧下叶磨玻璃样暗影（图3），入院时他有淋巴细胞削减症，C回响卵白和纤维卵白原升高，但原降钙素处于正常局限。在急诊病房采集的痰液样本中没有发现病原体。这名患者入住ICU，接管抗生素治疗，因病情发生好转于2019年12月29日出院。

图3.在基线时进行胸部CT扫描。

讨论

我们申报了一例COVID-19患者，该患者比法国的首批报道病例早了一个月。入院时，这名患者显现了之前在中国和意大利患者队列中常见的临床症状和放射学模式。确定第一例传染患者具有重大的风行病学意义，这是因为它极大地改变了我们对SARS-COV-2及其在法国流传的熟悉。

此外，因为这名患者与中国没有关联，比来也没有观光，这表明这种疾病在2019年12月底就已经在法国人群中流传。

还需要开展进一步的研究来评估SARS-COV-2在法国境内的实际发生情形、2019岁终和2020年1月时代SARS-COV-2在人群中的实际流传水平，并索求其时或者发生的未被注重到的灭亡情形。截止2020年5月10日，法国境内存在176782例COVID-19病例，个中26313例灭亡，然则我们的研究究竟表明，这些数字或者低估了COVID-19的实际肩负。

比来的2项研究提醒着大约18%~23%的SARS-COV-2传染者是无症状的；大约55%的传染者是由身份不明的传染者引起的。我们的究竟强烈支撑这两种概念，提出在2020年1月时代，很多无症状的患者没有被诊断出来，并促成了这一风行病的流传。

此外，因为这些究竟改变了我们对COVID-19疫情动态的懂得，这也意味着用于展望SARS-COV-2流传的演变和究竟的几个模型或者是基于有误差的数据，需要凭据疫情的实际概况进行调整。

我们的研究存在几个局限性。首先，因为所进行的剖析是回首性的，病历资料并不周全，或者漏掉了一些相关信息。其次，因为RT-PCR的活络度和或者损害样素质量的保留手艺，我们无法清扫假阴性究竟。为了避免任何假阳性究竟，我们接纳了所有平日的预防办法，我们经由两种分歧的手艺和分歧的工作人员对测试究竟进行验证。

第三，我们将我们的剖析限制在少数样本上，我们将所选的医学记录限制在仅限于症状和胸部CT相符的ICU患者，即使大多数患者实际上有稍微的症状。第四，我们将剖析局限限制在其时多重FilmArray PCR测定究竟为阴性的患者中，尽管文献中已经描述了交叉传染的情形。

最后，我们在巴黎北部区域进行了一项单中心研究，该区域在这一风行病中面临着稀奇高的肩负。这些限制或者注释着为何我们只能在我们研究的人群中识别出一例SARS-COV-2传染者。

参考资料：
A Deslandes et al. SARS-COV-2 was already spreading in France in late December 2019. International Journal of Antimicrobial Agents, 2020, doi:10.1016/j.ijantimicag.2020.106006.

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