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甲基化润饰,稀奇是DNA中的5-甲基胞嘧啶(5mC)和信使RNA(mRNA)中的N6-甲基腺苷(m6A)的甲基化,是由S-腺苷甲硫氨酸(SAM)依靠性甲基转移酶发生。这些润饰在动植物的生命运动中施展着主要的调节功能,并在多种肿瘤的发生成长中施展着主要的感化。尤其是作为近年来研究热点的m6A,它是真核细胞中mRNAs品貌最高的甲基化润饰,在包罗组织发育、干细胞自我更新和分化、热休克以及DNA伤害应答,母本合子(maternal-to-zygotic)转化等多个主要的生物学过程中饰演主要脚色。
当前高分文章揭橥及国度天然基金支撑情形均反映DNA及RNA甲基化,尤其是m6A已成为当前学术研究的热点偏向,是一个增进敏捷、拥有伟大研究意义的新兴范畴。鉴于DNA/RNA甲基化具有主要的临床研究意义,我们稀奇邀请到在该范畴拥有雄厚经验的专家先生为人人具体的介绍DNA/RNA甲基化的研究内容、研究偏向及课题思路,并经由..使学员熟练的把握甲基化相关课题的数据获得和剖析过程,敏捷成为表观遗传范畴的主力军。
1、理论连系实操;
2、案例讲解剖析连系;
3、协助剖析学员的实际数据
内容设置
第一天上午 8:30- 11:30 | DNA甲基化调控机制、科研应用及研究思路 | 1. 明确DNA甲基化的感化机制及调控机理。 2. 认识DNA甲基化在疾病等各研究范畴中的应用。 3. 认识DNA甲基化与转录组等多组学整合剖析思路。 4. 经由高分文章对DNA甲基化研究思路进行解读。 5. 把握DNA甲基化研究的多种手艺方式。 6. 认识常用DNA甲基化及疾病挖掘数据库。 | 理论 |
第一世界午 1:30- 17:00 | DNA甲基化芯片及测序数据剖析 | 1. DNA甲基化芯片及测序剖析常用软件介绍。 2. DNA甲基化芯片及测序数据剖析策略。 3. DNA甲基化芯片及测序剖析图表解读。 4. 差别甲基化判定、注释及富集剖析。 5. DNA甲基化芯片数据剖析 (ChAMP等软件)。 6. DNA甲基化测序数据剖析(bismark,methylKit等软件)。 7. DNA甲基化与转录组数据整合剖析。 8. 行使民众甲基化数据完成整套甲基化剖析流程。 | 实操 |
第一天晚上 18:00-21:00 | RNA甲基化功能机制、研究策略及思路剖析 | 1. RNA甲基化研究进展概述。 2. 认识RNA甲基化的概念和润饰类型。 3. 明确RNA甲基化对RNA加工代谢及生物学功能的调控机制。 4. 认识RNA甲基化在疾病等范畴中的研究应用。 5. 经由高分文献思路示例及总结对RNA甲基化调控肿瘤等功能研究思路进行解析。 6. 认识RNA甲基化常用的各类测序手艺。 7. m6A甲基化的研究近况、思路和研究方式。 | 理论 |
第二天上午 8:30- 11:30 | m6A甲基化数据剖析 | 1. 认识各类RNA甲基化润饰谱剖析手艺。 2. m6A测序手艺流程介绍及测序申报解读。 3. m6A常见剖析内容及相关软件介绍。 4. m6A peak判定(R包exomePeak、MACS2)、peak差别剖析(R包exomePeak)、motif剖析(Homer、MEME)及peak分布(RMBase)等。 5. m6A润饰基因的功能富集剖析(DAVID,Metascape、GSEA等)。 6. 展望m6A甲基化位点在线对象介绍。 7. m6A常用数据库介绍及使用(MeT-DB,m6AVar,RMBase) | 实操 |
第二世界午 1:30- 17:00 | m6A甲基化多组学整合剖析,课题设计与基金申请 | 1. m6A甲基化测序的项目延伸及思路拓展。 2. m6A甲基化与多组学数据(RNA-seq,Ribo-seq等)整合剖析。 3. 非编码RNA(miRNA及lncRNA等)的m6A甲基化剖析。 4. 经由TGGA、ICGC等数据库挖掘RNA甲基化癌症研究思路。 5. RNA甲基化研究策略与课题设计 。 6. RNA甲基化研究经验交流。 7. RNA甲基化相关国天然课题的介绍。 8. DNA及RNA甲基化基金申请思路、预备内容及方案设计注重事项等。 9. 商议及个性化问题答疑。 | 理论+实操 |
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介绍 集医疗、教授、科研于一体的大型三级甲等综合病院,是国度卫生健康委员会指定的全国疑难重症诊治指导中心,也是最早承担高干保健和外宾医疗义务的病院之一,以学科齐全、
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