7月，最值得看的30篇肠道健康文献！

压力与肥胖的亲密关系（综述）

Annual Review of Psychology[IF:22.774]

① 压力和肥胖是当今最普遍的两个健康问题，二者通过多个互作通路相连；② 压力促进肥胖的机制包括：影响认知过程（执行功能和自我调节等），影响行为（导致过量进食，食用高热量、高脂或高糖食物，减少身体活动，缩短睡眠），影响生理（改变下丘脑垂体肾上腺轴、大脑奖赏过程以及肠道菌群），影响生化活性物质的生成（瘦素、胃饥饿素和神经肽Y等）；③ 这些因素彼此间存在互作；④ 肥胖带来的对体重的耻辱感，反过来也会使压力上升。

Stress and Obesity

06-21  DOI: 10.1146/annurev-psych-010418-102936

Nature Reviews：炎症、代谢和菌群如何影响衰老（综述）

Nature Reviews Endocrinology[IF:20.265]

① 来自病原体、营养、肠道菌群和自身的信号，都可激活先天免疫，对先天免疫的长期刺激可引起慢性非感染的低度炎症，即炎性衰老；② 代谢炎症是由营养过度引起的慢性炎症，其分子机制在很大程度上与炎性衰老相同；③ 肠道菌群可释放炎性产物、影响生理节律、与其它器官和系统互作，在代谢炎症和炎性衰老中有核心作用；④ 炎性衰老导致的慢性疾病可加速衰老，DNA甲基化、糖组学、代谢组学和脂类组学等可用于研究代谢疾病中的衰老生物标志物。

Inflammaging: a new immune–metabolic viewpoint for age-related diseases

07-25  DOI: 10.1038/s41574-018-0059-4

Science：吃肉对健康和环境有哪些不好？（综述）

Science[IF:41.058]

① 全球肉类消费整体上升，以中国等中等收入国家最为明显；② 肉类是能量和蛋白质、铁、锌、维生素B12等营养元素的优质来源，但可通过吃其它多样化的食物来替代；③ 对高收入西方国家的研究表明，红肉和加工肉的高摄入与总死亡率上升相关，加工肉可增加结直肠癌、心血管疾病死亡、糖尿病等风险，可能与含有的潜在致癌物和饱和脂肪等有关；④ 肉类生产中（尤其是牛羊肉）单位能耗造成的温室气体排放超过植物类食物，对环境和生态造成不良影响。

Meat consumption, health, and the environment

07-20  DOI: 10.1126/science.aam5324

Cell子刊：补充膳食金属元素大有讲究（综述）

Cell Host and Microbe[IF:17.872]

① 膳食中的锌、铁、锰、铜、镍、钴、钼等过渡金属元素不仅是重要的营养物质，也有可能直接或间接地改变菌群的结构和功能；② “营养免疫”过程中，脊椎动物通过免疫蛋白螯合金属，限制细菌获取必需的金属元素，达到调节菌群的作用；③ 细菌，尤其是致病菌，产生了一系列获取、保存必须金属元素的机制来抵御宿主的“营养免疫”；④ 缺乏必需的金属元素会影响宿主的免疫机能，但不恰当地补充膳食金属有可能促进致病菌生长，恶化感染。

The Impact of Dietary Transition Metals on Host-Bacterial Interactions

06-13  DOI: 10.1016/j.chom.2018.05.008

Cell子刊：膳食硝酸盐对代谢健康有哪些好处？（综述）

Cell Metabolism[IF:20.565]

① 体内的硝酸盐主要源于膳食绿叶蔬菜和自身合成，经硝酸盐-亚硝酸盐-一氧化氮（NO）途径影响代谢健康；② 循环的硝酸盐由涎腺摄取并分泌在唾液中，经口腔细菌生成亚硝酸盐，在血液和组织中代谢为NO等生物活性氮氧化物；③ NO是心血管和代谢调节的多效性信号分子；④ 膳食硝酸盐对心血管和代谢的好处：降血压、改善内皮细胞功能、提高运动能力、逆转代谢综合征、抗糖尿病等；⑤ 其机制包括作用于线粒体呼吸、激活关键代谢调控通路、减少氧化应激。

Metabolic Effects of Dietary Nitrate in Health and Disease

07-03  DOI: 10.1016/j.cmet.2018.06.007

JAMA：糖尿病人每周2天大幅少吃，控血糖效果媲美长期控热量

JAMA[IF:44.405]

① 纳入137名2型糖尿病患者，随机分为2组，分别进行间断性及持续性能量限制；② 间断性限制组每周在不连续的2天只摄入500-600kcal能量（其他时间每天摄入约2100 kcal正常饮食），持续性限制组每天摄入1200-1500kcal能量，持续1年；③ 两组的平均HbA1c水平及体重均表现出相似的下降，前者达到等效标准；④ 在试验结束后，两组之间的空腹血糖水平、脂质水平、总服药量均无显著差异；⑤ 两组之间在治疗前两周中出现的低血糖或高血糖事件无显著差异。

Effect of Intermittent Compared With Continuous Energy Restricted Diet on Glycemic Control in Patients With Type 2 DiabetesA Randomized Noninferiority Trial

07-20  DOI: 10.1001/jamanetworkopen.2018.0756

赖信志等：冬虫夏草多糖的益生机制

Gut[IF:17.016]

① 口服中国被毛孢（冬虫夏草菌的无性阶段）菌丝及从中分离的高分子量多糖组分（H1），显著改善高脂饮食（HFD）喂养小鼠的肥胖和代谢紊乱；② H1改善肠道菌群和肠道完整性，减少代谢内毒素、炎症、胰岛素抵抗和血脂异常；③ 与肥胖负相关的新霉素敏感菌介导H1的抗肥胖作用，包括H1选择性促进的古氏副拟杆菌，给HFD小鼠口服该菌减少了小鼠的体重增长和代谢紊乱；④ H1和古氏副拟杆菌或是治疗肥胖和2型糖尿病的新型益生元/菌。

Gut commensal Parabacteroides goldsteinii plays a predominant role in the anti-obesity effects of polysaccharides isolated from Hirsutella sinensis

07-14  DOI: 10.1136/gutjnl-2017-315458

Cell子刊：肠道菌群产物怎样预防1型糖尿病？

Cell Metabolism[IF:20.565]

① 非肥胖糖尿病（NOD）小鼠的胰腺内分泌细胞表达β-防御素14（mBD14）不足，用MBD14治疗显著减少了小鼠的自身免疫性糖尿病；② MBD14经TLR2促进特定B细胞分泌IL-4，从而改善M1/M2巨噬细胞平衡，诱导调节性T细胞；③ 肠道菌群产物芳香烃受体（AHR）配体和丁酸，可促进胰腺天然淋巴细胞（ILC）分泌IL-23和IL-22，后者诱导胰腺内分泌细胞表达mBD14；④ NOD小鼠胰腺mBD14表达不足，与菌群失调（产丁酸菌减少）和遗传导致的AHR亲和力不足有关。

Gut Microbiota-Stimulated Innate Lymphoid Cells Support β-Defensin 14 Expression in Pancreatic Endocrine Cells, Preventing Autoimmune Diabetes

07-12  DOI: 10.1016/j.cmet.2018.06.012

Cell子刊：菌群产生的AhR配体，改善代谢综合征

Cell Metabolism[IF:20.565]

① 代谢综合征患者和动物模型中，肠道菌群代谢色氨酸生成芳香烃受体（AhR）配体的能力显著减弱，宿主生成的色氨酸代谢产物犬尿氨酸增多；② 给代谢综合征小鼠注射AhR激动剂Ficz或补充能生成大量AhR配体的罗伊氏乳杆菌CNCM I-5022，虽不减轻肥胖，但改善了糖代谢、脂肪肝和血脂；③ 机制是促进肠道屏障功能恢复、减少系统性炎症，并经AhR刺激肠内分泌细胞生成肠促胰岛素GLP-1；④ 用药物或改善菌群以增加AhR配体，是防治代谢综合征的新策略。

Impaired Aryl Hydrocarbon Receptor Ligand Production by the Gut Microbiota Is a Key Factor in Metabolic Syndrome

07-26  DOI: 10.1016/j.cmet.2018.07.001

Nature子刊：抗生素导致的菌群缺失影响宿主代谢稳态

Nature Communications[IF:12.353]

① 抗生素导致的菌群缺失（AIMD）减少了肠腔内厚壁菌和拟杆菌，改善了宿主的血糖状况，在肥胖状态不变的情况下提高了胰岛素敏感性；② AIMD减少了肠腔内以丁酸盐和次级胆汁酸为代表的短链脂肪酸（SCFA），影响了宿主整体的胆汁酸代谢；③ AIMD改变盲肠细胞的基因表达以及肠道内1型肠胰高血糖素样肽的信号反馈；④ 组织重构和SCFA变化导致肠细胞的能量代谢由利用SCFA转为葡萄糖；⑤ AIMD可能通过改变肠细胞的能量代谢类型，改变宿主的葡萄糖稳态。

Antibiotic-induced microbiome depletion alters metabolic homeostasis by affecting gut signaling and colonic metabolism

07-20  DOI: 10.1038/s41467-018-05336-9

Nature子刊：鼠李糖乳杆菌限制沃氏嗜胆菌对代谢的不良影响

Nature Communications[IF:12.353]

① 高脂饮食（HFD）促进致病共生菌沃氏嗜胆菌生长；② 增加小鼠肠道中的沃氏嗜胆菌，加剧了HFD诱导的炎症、肠道屏障功能紊乱和胆汁酸代谢障碍，促进了糖代谢紊乱和脂肪肝；③ 沃氏嗜胆菌还作用于菌群，促进LPS生成和移位、减少丁酸生成；④ 沃氏嗜胆菌对血糖控制和肝稳态的不良影响，可独立于其促炎症作用；⑤ 通过限制沃氏嗜胆菌的生长、减少炎症和增强肠道屏障，补充鼠李糖乳杆菌CNCM I-3690可减少沃氏嗜胆菌诱导的小鼠免疫和代谢损伤。

Bilophila wadsworthia aggravates high fat diet induced metabolic dysfunctions in mice

07-18  DOI: 10.1038/s41467-018-05249-7

Nature子刊：一文读懂NAFLD（综述）

Nature Medicine[IF:32.621]

① 非酒精性脂肪性肝病（NAFLD）是从非酒精性脂肪肝（NAFL）到非酒精性脂肪性肝炎（NASH）的连续性肝脏异常；② 代谢综合症（MetS）是NAFLD和NASH的最强危险因素；③ 发病机制可能是：脂肪酸供应过多导致毒性脂质形成及堆积，触发内质网应激、氧化应激和炎症小体活化，激活星状细胞，导致纤维形成；④ 胰岛素抵抗、肠道菌群紊乱也在发病机制中起重要作用；⑤ 潜在治疗靶点包括：代谢、细胞应激及凋亡、免疫细胞及细胞因子、纤维化、肠道菌群等。

Mechanisms of NAFLD development and therapeutic strategies

07-02  DOI: 10.1038/s41591-018-0104-9

Nature：琥珀酸让脂肪产热，或能帮助减肥

Nature[IF:41.577]

① 琥珀酸是三羧酸循环的中间产物，暴露于寒冷环境可激活脂肪产热，其代谢特征是琥珀酸的积累；② 琥珀酸积累独立于肾上腺素信号，足以提升褐色脂肪的生热呼吸；③ 给小鼠静脉注射琥珀酸，可快速激活褐色脂肪产热，该作用需要琥珀酸脱氢酶，通过琥珀酸氧化启动活性氧生成，从而驱动生热呼吸；④ 通过饮水给食用高脂饮食的小鼠补充琥珀酸，可增加系统循环中的琥珀酸，驱动依赖于UCP1的褐色脂肪产热，从而使小鼠抵抗饮食诱导的肥胖和血糖问题。

Accumulation of succinate controls activation of adipose tissue thermogenesis

07-18  DOI: 10.1038/s41586-018-0353-2

Immunity：微生物生成的琥珀酸，引起肠道免疫应答

Immunity[IF:19.734]

① 小肠中，簇细胞和2型天然淋巴细胞（ILC2）形成的信号回路调控2型免疫应答；② 小肠、胆囊、结肠、胸腺和气管中的簇细胞具有组织特异的化学感受受体；③ 小肠簇细胞表达琥珀酸受体（SUCNR1），通过饮水让小鼠摄入琥珀酸，足以经簇细胞-ILC2回路诱导多层面的2型免疫应答，包括ILC2活化、簇细胞和杯状细胞增生、嗜酸粒细胞增多；④ 三毛滴虫和巴西日圆线虫均可生成代谢物琥珀酸，二者分别通过SUCNR1依赖和非依赖的机制，被肠道免疫感知。

Detection of Succinate by Intestinal Tuft Cells Triggers a Type 2 Innate Immune Circuit

07-17  DOI: 10.1016/j.immuni.2018.06.016

郑树森+李兰娟+阚全程：菌群标志物有望诊断早期肝癌

Gut[IF:17.016]

① 分析健康、肝硬化和肝细胞癌（HCC）患者的粪便菌群；② 从健康到肝硬化，菌群多样性下降，而从肝硬化到早期HCC，菌群多样性上升；③ 与肝硬化患者相比，早期HCC患者的放线菌门增加，芽殖菌和副拟杆菌等13个菌属富集；④ 与健康个体相比，早期HCC患者中产丁酸的细菌菌属减少，生成脂多糖的菌属增加；⑤ 建立含30个菌群标志物的诊断模型，诊断准确性较高（在75个早期HCC和105个非HCC样本中AUC=80.64%），并在中国不同地域的患者样本中得到验证。

Gut microbiome analysis as a tool towards targeted non-invasive biomarkers for early hepatocellular carcinoma

07-25  DOI: 10.1136/gutjnl-2017-315084

中山大学等：一种新的大肠癌粪便生物标志物

Clinical Chemistry[IF:8.636]

① 选取2个队列共903名个体，利用qPCR检测粪便中具核梭杆菌（Fn）、柔嫩梭菌群（Fp）、双歧杆菌属（Bb）、乳杆菌属（Lb）的相对丰度；② 在结直肠癌检测中，Fn与Bb的比值（Fn/Bb）的敏感性为84.6%，特异性为92.3%，AUC为0.911；③ 结合Fn/Bb及Fn/Fp，可显著改善诊断结直肠癌的效果，AUC可达0.943；④ 结合Fn/Bb及Fn/Fp，可以60.0%的敏感性及90.0%的特异性（AUC=0.804）检测I期结直肠癌；⑤ 在结直肠癌患者群体中，Fn与Fp的丰度呈负相关。

A Simple and Novel Fecal Biomarker for Colorectal Cancer: Ratio of Fusobacterium Nucleatum to Probiotics Populations, Based on Their Antagonistic Effect

06-18  DOI: 10.1373/clinchem.2018.289728

Science：抑制肠道慢性炎症或能治疗肠道息肉

Science[IF:41.058]

① LKB1是一个丝氨酸/苏氨酸激酶，参与细胞增殖及代谢，其突变与肿瘤及胃肠息肉发生相关；② LKB1杂合子小鼠会自发性生成胃肠息肉，但如果特异性地在肠上皮细胞中敲除则无此表型，提示LKB1在非上皮细胞中有作用；③ 在T细胞中特异性半敲除LKB1，导致小鼠自发性胃肠息肉，伴随免疫细胞浸润、STAT3活化，以及IL-6、IL-11和CXCL2等炎症因子表达升高；④ IL6缺失和JAK2抑制剂均可有效缓解肠息肉，提示抑制肠道慢性炎症可作为该病的治疗策略。

LKB1 deficiency in T cells promotes the development of gastrointestinal polyposis

07-27  DOI: 10.1126/science.aan3975

Gut：应对IBD的关键——饮食（必读综述）

Gut[IF:17.016]

① 近3年来，关于炎症性肠病（IBD）的发生机制有激动人心的进展，特别是明确了在遗传之外，环境尤其是因饮食而改变的肠道菌群至关重要；② 在针对克罗恩病人的治疗中，肠外营养被证明可缓解症状，施行4周以上，可减少外科手术介入；③ 基于肠外营养方案剔除特定成分的饮食、特定天然食品都可缓解病情，并作为生物或组合疗法失效后的挽救治疗；④ 对病人进行饮食教育值得推崇，虽然还在起步阶段，但利用饮食治疗IBD的方法应该会在临床带来获益。

Evolving role of diet in the pathogenesis and treatment of inflammatory bowel diseases

05-18  DOI: 10.1136/gutjnl-2017-315866

饮食改变肠道菌群，引起易感个体结肠炎发作

Gastroenterology[IF:20.773]

① R23FR小鼠中CX3CR1+ 骨髓细胞过表达IL23，可引起类似人溃疡性结肠炎的反复发作型肠道炎症；② 这些小鼠的症状发作是由饲料调换引起，两种饲料在营养配比上差异很小；③ 引发症状的饲料快速改变小鼠肠道菌群，使疣微菌门增多、拟杆菌门减少，发作期变形菌门丰度显著改变；④ 这些菌群变化诱导了R23FR小鼠中一类CD4+ T细胞的大量增殖，介导IL23过表达导致的结肠炎；⑤ IL23促进特定CD4+ T细胞生成，后者可响应饮食诱导的菌群变化，引起结肠炎。

Diet Modifies Colonic Microbiota and CD4+ T Cell Repertoire to Induce Flares of Colitis in Mice With Myeloid-cell Expression of Interleukin 23

06-14  DOI: 10.1053/j.gastro.2018.06.034

Cell子刊：共生菌代谢物有助于抗感染

Cell Host and Microbe[IF:17.872]

① 拟杆菌属细菌产生丙酸这一短链脂肪酸，通过扰乱鼠伤寒沙门氏菌的细胞内酸碱平衡来阻碍其生长，产生抵御该致病菌感染的定植抗性；② 肠道菌群制约沙门氏菌在远端肠道中的扩散，控制其在粪便中的数量；③ 拟杆菌属产生的丙酸介导了共生菌群对沙门氏菌的定植抗性，抵御沙门氏菌感染；④ 丙酸通过扰乱沙门氏菌的细胞内pH稳态，对该致病菌产生直接的生长抑制作用，增加小鼠肠道的丙酸水平有助于抵御鼠伤寒沙门氏菌感染。

A Gut Commensal-Produced Metabolite Mediates Colonization Resistance to Salmonella Infection

07-26  DOI: 10.1016/j.chom.2018.07.002

Immunity：肠道菌群如何保护肠道免疫稳态？

Immunity[IF:19.734]

① 肠道菌群被抗生素破坏的小鼠感染沙门氏菌时，肠道内表达趋化因子受体CX3CR1的单核吞噬细胞（MNP）驱动Th1细胞增殖，促进肠道炎症；② 而肠道菌群存在时，CX3CR1+ MNP可生成抗炎细胞因子IL-10，限制促炎症的Th1和Th17细胞扩增、促进Treg细胞分化，从而抑制对肠道中食物和菌群抗原的炎症性应答；③ CX3CR1+ MNP的这些作用，依赖于其抗原呈递功能；④ 在清除菌群的小鼠肠道内定殖能粘附于肠上皮的大肠杆菌，可以诱导CX3CR1+ MNP的抗炎作用。

Critical Role for the Microbiota in CX3CR1+ Intestinal Mononuclear Phagocyte Regulation of Intestinal T Cell Responses

07-03  DOI: 10.1016/j.immuni.2018.05.009

Nature Reviews：一文读懂肠道上皮内T细胞（综述）

Nature Reviews Gastroenterology and Hepatology[IF:16.99]

① 胃肠道上皮屏障中有许多上皮内T细胞（IET），是最早接触菌群及饮食抗原的适应性免疫细胞；② 树突细胞通过呈递肠道菌群抗原给IET，促进IET的扩增，菌群及其代谢产物被肠道上皮细胞（IEC）感知后，可诱导T细胞的分化、调节T细胞的功能；③ 饮食及菌群中的芳香烃受体（AhR）配体或可诱导上皮膜修复、免疫防御及IET维持；④ 靶向IL-15以抑制IET的增殖、存活、细胞毒性可用于治疗乳糜泻，靶向整合素以抑制IET的迁移可用于治疗IBD。

The elusive case of human intraepithelial T cells in gut homeostasis and inflammation

07-04  DOI: 10.1038/s41575-018-0039-0

浙大韩新燕等：粪菌移植增强菌群色氨酸代谢，改善肠道屏障

Journal of Crohn's and Colitis[IF:6.637]

① 新生仔猪分为实验和对照组，前者一出生即接受来自健康成年猪的粪菌移植（FMT）；② FMT调节仔猪的结肠菌群多样性和组成，并降低对脂多糖（LPS）诱导的上皮完整性破坏和严重炎症反应的易感性；③ 受体仔猪的肠道代谢组功能改变，结肠腔中菌群衍生的色氨酸分解代谢物吲哚-3-乙酸显著增加，伴随细胞因子IL-22的上调和芳香烃受体的活化增强；④ FMT对受体结肠中菌群色氨酸代谢的调节作用，可能在维持肠屏障中有潜在作用。

Fecal Microbiota Transplantation Reduces Susceptibility to Epithelial Injury and Modulates Tryptophan Metabolism of Microbial Community in a Piglet Model

07-14  DOI: 10.1093/ecco-jcc/jjy103

Nature子刊：肠道菌群与常见疾病和药物的大规模相关性研究

Nature Communications[IF:12.353]

① 在英国TwinsUK队列中（>2700人），分析粪便菌群与38种常见疾病及51个处方药之间的关联；② 用68个分类单元和菌群多样性作为肠道菌群组成的核心标志物，17种疾病与至少1个菌群标志物显著相关，α多样性与多种疾病显著负相关；③ 单个菌群标志物大多在多种疾病/并存病中呈现一致的相关性，提示特定菌群标志物的变化不是疾病特异性的，而是反映整体健康情况；④ 菌群标志物与19个处方药显著相关，疾病与所用药物及其与菌群的关联存在复杂互作。

Gut microbiota associations with common diseases and prescription medications in a population-based cohort

07-09  DOI: 10.1038/s41467-018-05184-7

Nature Reviews：迄今为止，已有200+关键菌群分类被鉴定！

Nature Reviews Microbiology[IF:31.851]

① 菌群的物种组成极为复杂，但科学家在土壤、植物、海洋和人体共生菌群中鉴定出超过200个关键分类，它们对菌群结构和功能起到驱动作用；② 利用生态网络分析方法可以鉴定出这些关键分类，联合高平均度、高接近中心度和低中介中心度鉴定等方法，准确率可达85%；；③ 基于统计的方法存有局限性，尤其需要注意相关性不意味着一定具有因果关系，对此应谨慎解读；④ 结构方程模型等方法可突破相关性，在关键分类和菌群组成或功能之间探索因果关系。

Keystone taxa as drivers of microbiome structure and functioning

05-22  DOI: 10.1038/s41579-018-0024-1

Cell子刊：饮食决定宿主与细菌的共生关系

Cell Host and Microbe[IF:17.872]

① 宿主的营养环境而不是宿主本身，是决定植物乳杆菌维持有利于宿主的共生机制的主要因素；② 植物乳杆菌醋酸激酶基因（ackA）的点突变可以增强植物乳杆菌的适应性，并促进宿主果蝇的生长；③ ackA基因突变的维持主要受宿主饮食的影响，与宿主本身无关；④ ackA基因突变促进N-乙酰化氨基酸的产生，其中包括N-乙酰基谷氨酰胺；⑤ 植物乳杆菌产生的N-乙酰基谷氨酰胺，足以提高该菌对果蝇生长的促进作用。

Bacterial Adaptation to the Host's Diet Is a Key Evolutionary Force Shaping Drosophila-Lactobacillus Symbiosis

06-28  DOI: 10.1016/j.chom.2018.06.001

Cell子刊：婴儿的菌群发育，母亲的直接贡献很大

Cell Host and Microbe[IF:17.872]

① 对25对母婴的多个身体部位进行纵向取样，分析婴儿出生后4个月内的口腔和肠道菌群的来源和母亲菌群纵向传递的作用；② 婴儿出生时随机定殖大量来自母亲不同部位的微生物，随后，所处部位的生理环境对菌群进行强力选择，使菌群多样性先快速下降、后逐渐上升；③ 种和株水平的分析表明，来自母亲的微生物持续地传递给婴儿，婴儿的肠道菌群和口腔菌群与母亲同部位菌群的相似度随时间增加；④ 母亲向婴儿传递的菌株主要来自肠道菌群。

Mother-to-Infant Microbial Transmission from Different Body Sites Shapes the Developing Infant Gut Microbiome

07-11  DOI: 10.1016/j.chom.2018.06.005

Cell子刊：孩子继承母亲的肠道细菌有什么规律？

Cell Host and Microbe[IF:17.872]

① 在44对母婴中，分析婴儿出生头3个月的肠道菌群动态，纵向评估母亲向婴儿传递肠道细菌的模式；② 对某个菌种而言，多数情况下，孩子会继承母亲的优势菌株，但次要菌株的传递也时有发生；③ 次要菌株的定殖似乎是由功能选择所驱动，比如：当母亲的单形拟杆菌的主要菌株缺乏促进代谢母乳的淀粉利用基因时，具有该基因的次要菌株可在孩子肠道内定殖；④ 母亲菌群中的抗生素耐药基因也会传递给孩子。

Strain-Level Analysis of Mother-to-Child Bacterial Transmission during the First Few Months of Life

07-11  DOI: 10.1016/j.chom.2018.06.007

FAST：粪便样本分装、储存和二次取样的新方法

Microbiome[IF:9.133]

① 粪便等分吸管技术（FAST）使用吸管从最近排便或保存在低温但未冷冻的样品中收集粪便；② FAST处理的样品可以在超低温下长时间有效储存，可在不解冻的情况下轻松进行二次取样，并需要最少的供应和存储空间，在实验室和现场使用都很方便；③ 16S rRNA测序证实该方法在同一受试者中高度可重复的二次取样能力；④ FAST处理的样品移植到无菌小鼠中，平均保留了约80％的供体细菌群落，并提示菌群胆碱代谢和氧化三甲胺积累的人际差异很大。

Fecal Aliquot Straw Technique (FAST) allows for easy and reproducible subsampling: assessing interpersonal variation in trimethylamine-N-oxide (TMAO) accumulation

05-18  DOI: 10.1186/s40168-018-0458-8

稳定同位素探测用于菌群功能研究（综述）

Trends in Microbiology[IF:11.776]

① 菌群宿主共生系统可概念化为大量元素(C,H,O,N,S,P)和微量元素(Fe,Zn,Mg等)的质量守恒；② 共生系统新元素的来源是食物，宿主消化和分解食物，吸收营养并产生分泌物，菌群利用和代谢这些衍生物，也产生被宿主吸收的短链脂肪酸等化合物；③ DNA/RNA-SIP，PLFA-SIP，Protein-SIP和显微拉曼光谱、NanoSIMS等稳定同位素探测方法，允许从系统生物学研究中检验假说和发现新功能；④ 可被用于确定微生物营养利用策略和竞争、合作和互养等生态关系。

Stable-Isotope Probing of Human and Animal Microbiome Function

07-10  DOI: 10.1016/j.tim.2018.06.004

来源：热心肠研究院